작중 시간으로 A.G.(Advanced Generation) 101년부터 갑자기 나타난 정체불명의 세력으로, 자세한 내부 상황이나 지휘체계, 심지어 인간인지 외계인인지도 확실하지 않은 그야말로 미지의 적. 베이건이라는 이름이 공식적으로 발표되기 전까지는 작중에서나 각종 정보 등지에서도 정체 불명의 적이라는 뜻으로 UE(Unknown Enemy)라고 불렸다. 이들에 의해 스페이스 콜로니 엔젤이 공격받아 붕괴되는 사건이 발생했고(이른바 '천사의 낙일'), 그 이후로 베이건은 지구권에 사는 사람들을 괴롭히게 된다. 작중 지구를 통치하는 지구연방과 지구연방군도 첫 공격 이후 14년 동안 속수무책이었던 듯. 1화에서 이들의 양산기 중 하나인 가프랑 1기를 겨우 격파한 게 14년 동안의 유일한 승전 사례였다.

주인공 플리트 아스노가 원래 살고 있던 콜로니 오르반도 A.G. 108년에 습격당하였고, 플리트는 이때 어머니를 잃었다. 이로부터 7년 후인 A.G. 115년에 14살이 된 플리트가 머무르던 스페이스 콜로니 노라의 연방군 기지 아린스톤도 공격당하여 플리트가 건담 AGE-1을 타고 그들과 맞서게 된다는 것이 주요 스토리 라인.

본편에서는 베이건의 병기들은 건담 AGE-1의 빔 대거와 돗즈 라이플을 제외하고는 인류의 어떤 무기에도 타격을 입지 않았으며, 단 3기만으로 콜로니의 한 지역(혹은 그 이상)을 불바다로 만드는 등 당대 인류의 모빌슈트에 비해 몇 세대는 앞서나간 성능을 보여주었다. G-에그제스의 등장으로 단독으로 베이건과 싸울 수 있는 모빌슈트가 2기로 늘었지만 베이건의 우세함은 변치 않은 상황이다. 건담과 에그제스를 제외한 다른 모빌슈트는 여전히 상대가 되지 않고 아무리 전투력이 높아도 고작 2기로 전쟁이 안된다.

UE라는 이름으로 알려졌을 때는 이들의 진짜 정체에 대해 건담 AGE 시청자들의 추측 및 설왕설래가 계속 이어지고 있었다.

외계인이다, 인간이다, 인간이라면 외행성 이주민 설이거나, 테러리스트 및 비밀결사, 아니면 지구연방이 흑막이거나 이외에도 이세계인(다른 차원의 존재), 무인로봇 등 여러 가지 추측이 오갔다.

결국 밝혀진 진실은 인간이며 외행성 이주민이였다.

그들은 150년 전, 지구연방이 추진한 화성 이주계획 마즈 버스데이에 따라서 실험적으로 16기의 콜로니를 화성권에 이주시켰다. 하지만 화성의 자기폭풍 마즈 레이에 의해 이주민의 20%가 죽거나 불치병에 걸리게 되었고, 계획은 실패했다. 연방은 자신들의 조사 부족을 은폐하고, 화성 이주민에 대한 지원을 끊어버렸다. 남겨진 사람들은 화성의 가혹한 환경과 싸워 살아남았고, 지구권으로의 귀환을 위해 국가를 조직했고, 그것이 UE의 진정한 이름 베이건이다. 즉 화성 이주민들. 다만 어떻게 연방을 초월하는 기술력을 가지고 있는지는 아직 확실하게는 밝혀지지 않았다.